8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_59684
Cell Name :  21_06_05_c1_100
Archive Name :  Kole
Species Name :  rat
Strain :  WAG/Rij
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  140.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, hindlimb representation, layer 5b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-12-16
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  21_06_05_c1_100.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Inherited cortical HCN1 channel loss amplifies dendritic calcium electrogenesis and burst firing in a rat absence epilepsy model.

Measurements
Soma Surface :  1643.26 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  58
Number of Branches :  126
Overall Width :  338.48 μm
Overall Height :  1379.73 μm
Overall Depth :  208.31 μm
Average Diameter :  1.38 μm
Total Length :  14545.2 μm
Total Surface :  65941.9 μm2
Total Volume :  34836.3 μm3
Max Euclidean Distance :  1256.44 μm
Max Path Distance :  1704.41 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  16046
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  98.97°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.97°
Fractal Dimension :  1.07

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