8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_191071
Cell Name :  216926-6mo-GFAP-IFN-20x-cerebellum-iba1-3_1
Archive Name :  West_Hofer
Species Name :  mouse
Strain :  GFAP-IFN
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  6.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  cerebellum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.hoc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  interferon (IFN-alpha) chronic production
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2022-05-20
Date of Upload :  2022-06-23
Persistence Vector :  216926-6mo-GFAP-IFN-20x-cerebellum-iba1-3_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The cytokines interleukin-6 and interferon-α induce distinct microglia phenotypes.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  56
Overall Width :  36.66 μm
Overall Height :  86.97 μm
Overall Depth :  76.27 μm
Average Diameter :  1.89 μm
Total Length :  707.84 μm
Total Surface :  4217.15 μm2
Total Volume :  2282.18 μm3
Max Euclidean Distance :  60.88 μm
Max Path Distance :  80.52 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  1919
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2.1
Average Bifurcation Angle Local :  68.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.24°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website