8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_272960
Cell Name :  21343rbmko_06
Archive Name :  Plachez
Species Name :  mouse
Strain :  Robo3 R3?5 cKO
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Robo3 conditional knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2023-09-15
Date of Upload :  2023-09-20
Persistence Vector :  21343rbmko_06.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Layers 3 and 4 Neurons of the Bilateral Whisker-Barrel Cortex.

Measurements
Soma Surface :  550.18 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  34
Overall Width :  201.35 μm
Overall Height :  349.32 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  1837.62 μm
Total Surface :  5773.06 μm2
Total Volume :  1443.27 μm3
Max Euclidean Distance :  221.93 μm
Max Path Distance :  251.84 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  2896
Partition Asymmetry :  0.38
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  67.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  63.71°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website