8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275636
Cell Name :  20x_strep_stack_neu-exported-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  20x_strep_stack_neu-exported-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  12.29 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  61
Overall Width :  204.2 μm
Overall Height :  339.04 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2151.47 μm
Total Surface :  1689.76 μm2
Total Volume :  105.61 μm3
Max Euclidean Distance :  264.32 μm
Max Path Distance :  308.63 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  2541
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  47.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.22°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website