8.6.92 - Released: 2025-10-03 - Content: 280015 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_167347
Cell Name :  205-n3
Archive Name :  Kojic
Species Name :  mouse
Strain :  DBA2/J; Elp2H206R/R464W
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Elp2 knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2021-09-08
Date of Upload :  2021-11-01
Persistence Vector :  205-n3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Elp2 mutations perturb the epitranscriptome and lead to a complex neurodevelopmental phenotype.

Measurements
Soma Surface :  2.49 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  28
Overall Width :  172.51 μm
Overall Height :  198.4 μm
Overall Depth :  61 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  1587.13 μm
Total Surface :  1246.53 μm2
Total Volume :  77.91 μm3
Max Euclidean Distance :  132.55 μm
Max Path Distance :  175.89 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  5087
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  30.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.64°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website