8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296883
Cell Name :  20211210_C02_2p_recon_v3
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  neonatal
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  20211210_C02_2p_recon_v3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  271.18 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  66
Number of Branches :  145
Overall Width :  34.56 μm
Overall Height :  33.57 μm
Overall Depth :  5.66 μm
Average Diameter :  0.61 μm
Total Length :  693.27 μm
Total Surface :  1440.79 μm2
Total Volume :  274.82 μm3
Max Euclidean Distance :  30.31 μm
Max Path Distance :  38.06 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  501
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  1.63
Average Bifurcation Angle Local :  73.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.05°
Fractal Dimension :  1.05

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