8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296884
Cell Name :  20211101_C02_recon_v4
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  20211101_C02_recon_v4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  240.27 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  150
Number of Branches :  312
Overall Width :  65.17 μm
Overall Height :  59.93 μm
Overall Depth :  8.03 μm
Average Diameter :  0.79 μm
Total Length :  1817.62 μm
Total Surface :  4833.67 μm2
Total Volume :  1186.87 μm3
Max Euclidean Distance :  44.61 μm
Max Path Distance :  53.98 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  859
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.65
Average Bifurcation Angle Local :  76.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.48°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website