8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296881
Cell Name :  20211101_C01_recon_v3
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  16.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  20211101_C01_recon_v3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  501.12 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  186
Number of Branches :  384
Overall Width :  109.3 μm
Overall Height :  76.51 μm
Overall Depth :  9.31 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  2937.11 μm
Total Surface :  9932.74 μm2
Total Volume :  3053.18 μm3
Max Euclidean Distance :  74.85 μm
Max Path Distance :  91.14 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1135
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  71.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.37°
Fractal Dimension :  1.04

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