8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_296887
Cell Name :  20210930_C01_recon_v3
Archive Name :  Sjostrom
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  17.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  astrocyte
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Streptavidin-conjugated Alexa 647
Slicing Direction :  oblique coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2025-04-11
Date of Upload :  2025-04-24
Persistence Vector :  20210930_C01_recon_v3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The developmental profile of visual cortex astrocytes.

Measurements
Soma Surface :  199.18 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  89
Number of Branches :  185
Overall Width :  55.45 μm
Overall Height :  51.35 μm
Overall Depth :  1.43 μm
Average Diameter :  0.84 μm
Total Length :  1082.01 μm
Total Surface :  3187.61 μm2
Total Volume :  951.93 μm3
Max Euclidean Distance :  48.2 μm
Max Path Distance :  60.56 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  642
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  75.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.31°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website