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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161883
Cell Name :  20191114_sample_4
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Viaat-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  77.0 days
Max Age :  77.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Vesicular inhibitory amino acid transporter (VIAAT)-positive
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20191114_sample_4.pvec
Note :  Abundant in L2/3, Martinotti morphology, adapting firing pattern. "Fanning-out" Martinotti morphology in upper L5. Non-zero ADP.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  18.77 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  15
Overall Width :  113.17 μm
Overall Height :  243.74 μm
Overall Depth :  84.68 μm
Average Diameter :  0.9 μm
Total Length :  1623.09 μm
Total Surface :  4578.63 μm2
Total Volume :  1060.82 μm3
Max Euclidean Distance :  180.07 μm
Max Path Distance :  282.91 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.67
Total Fragmentation :  581
Partition Asymmetry :  0.6
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  70.76°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.68°
Fractal Dimension :  1.09

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