8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161841
Cell Name :  20191108_sample_5
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Vipr2-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  99.0 days
Max Age :  99.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Intratelencephalic (IT), Vasoactive intestinal peptide receptor 2 (VIPR2)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20191108_sample_5.pvec
Note :  L5. Large tufted pyramidal neurons.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  976.07 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  96
Overall Width :  256.16 μm
Overall Height :  681.58 μm
Overall Depth :  266.45 μm
Average Diameter :  0.61 μm
Total Length :  8009.29 μm
Total Surface :  15674.3 μm2
Total Volume :  3783.99 μm3
Max Euclidean Distance :  638.53 μm
Max Path Distance :  877.93 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  4273
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  80.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.47°
Fractal Dimension :  1.07

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