8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161504
Cell Name :  20190725_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  51.0 days
Max Age :  51.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 6
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190725_sample_1.pvec
Note :  Cholecystokinin (CCK)-positive. Deep L5 and L6, large axonal arborization.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  211.24 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  62
Overall Width :  151.09 μm
Overall Height :  228.19 μm
Overall Depth :  96.95 μm
Average Diameter :  0.34 μm
Total Length :  3104.77 μm
Total Surface :  3202.57 μm2
Total Volume :  373.92 μm3
Max Euclidean Distance :  150.47 μm
Max Path Distance :  209.95 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  2203
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.47
Average Bifurcation Angle Local :  91.92°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.26°
Fractal Dimension :  1.07

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