8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161242
Cell Name :  20190710_sample_6
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  67.0 days
Max Age :  67.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190710_sample_6.pvec
Note :  L6, mostly local arborization within L6. This reconstruction belongs to the SOM Th_3 subclass.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  470.9 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  130
Number of Branches :  267
Overall Width :  363.91 μm
Overall Height :  956.92 μm
Overall Depth :  222.15 μm
Average Diameter :  0.28 μm
Total Length :  15847.7 μm
Total Surface :  13253.2 μm2
Total Volume :  2242.33 μm3
Max Euclidean Distance :  735.99 μm
Max Path Distance :  1109.76 μm
Max Branch Order :  29
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  2761
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  90.71°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.9°
Fractal Dimension :  1.06

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