8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161605
Cell Name :  20190627_sample_8
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Viaat-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  98.0 days
Max Age :  98.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Intratelencephalic (IT), Vesicular inhibitory amino acid transporter (VIAAT)-positive
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190627_sample_8.pvec
Note :  L5. Large tufted pyramidal neurons.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  1272.65 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  30
Overall Width :  174.54 μm
Overall Height :  410.85 μm
Overall Depth :  105.2 μm
Average Diameter :  1.22 μm
Total Length :  2173.3 μm
Total Surface :  8278.26 μm2
Total Volume :  2757.81 μm3
Max Euclidean Distance :  405.71 μm
Max Path Distance :  537.96 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  1639
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.71
Average Bifurcation Angle Local :  69.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.5°
Fractal Dimension :  1.08

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