8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161241
Cell Name :  20190625_sample_4
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  67.0 days
Max Age :  67.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 1
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive, high-input resistance, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190625_sample_4.pvec
Note :  Abundant in L2/3, strong CCK expression, local dendritic and axonal morphologies "small CCK Basket cell". High input resistance.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  382.56 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  64
Number of Branches :  133
Overall Width :  310.75 μm
Overall Height :  282.19 μm
Overall Depth :  145.61 μm
Average Diameter :  0.28 μm
Total Length :  7833.8 μm
Total Surface :  7346.37 μm2
Total Volume :  1585.44 μm3
Max Euclidean Distance :  411.57 μm
Max Path Distance :  773.29 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  4052
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.16
Average Bifurcation Angle Local :  83.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.24°
Fractal Dimension :  1.08

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