8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161433
Cell Name :  20190624_sample_2
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  75.0 days
Max Age :  75.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190624_sample_2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  1087.03 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  72
Number of Branches :  153
Overall Width :  257.75 μm
Overall Height :  831.88 μm
Overall Depth :  255.72 μm
Average Diameter :  0.22 μm
Total Length :  9850.44 μm
Total Surface :  5926.71 μm2
Total Volume :  619.88 μm3
Max Euclidean Distance :  664.52 μm
Max Path Distance :  921.15 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.73
Total Fragmentation :  6259
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.74
Average Bifurcation Angle Local :  98.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.31°
Fractal Dimension :  1.09

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