8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161835
Cell Name :  20190611_sample_15
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  103.0 days
Max Age :  103.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Inhibitory
Tertiary Cell Class :  Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived, Parvalbumin (PV)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190611_sample_15.pvec
Note :  Canopy cells in L1: Nndf positive, NPY negative.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  808.79 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  102
Number of Branches :  211
Overall Width :  300.1 μm
Overall Height :  405.18 μm
Overall Depth :  122.17 μm
Average Diameter :  0.24 μm
Total Length :  9852.64 μm
Total Surface :  7900.89 μm2
Total Volume :  1645.52 μm3
Max Euclidean Distance :  309.67 μm
Max Path Distance :  829.38 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  3178
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  86.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.77°
Fractal Dimension :  1.07

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