8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161847
Cell Name :  20190605_sample_4
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  74.0 days
Max Age :  74.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190605_sample_4.pvec
Note :  Located in L2/3, upper L5.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  87.42 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  53
Number of Branches :  111
Overall Width :  238.85 μm
Overall Height :  351.46 μm
Overall Depth :  142.42 μm
Average Diameter :  0.33 μm
Total Length :  4614.66 μm
Total Surface :  4672.65 μm2
Total Volume :  855.87 μm3
Max Euclidean Distance :  269.78 μm
Max Path Distance :  472.67 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.73
Total Fragmentation :  3193
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  95.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.42°
Fractal Dimension :  1.08

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