8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161826
Cell Name :  20190528_sample_9
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  93.0 days
Max Age :  93.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190528_sample_9.pvec
Note :  Located in L2/3, upper L5.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  731.03 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  76
Overall Width :  168.4 μm
Overall Height :  287.65 μm
Overall Depth :  61.83 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  3442.44 μm
Total Surface :  5779.38 μm2
Total Volume :  1308.44 μm3
Max Euclidean Distance :  200.89 μm
Max Path Distance :  376.81 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.7
Total Fragmentation :  2043
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  78.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.7°
Fractal Dimension :  1.08

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