8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161649
Cell Name :  20190509_sample_2
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  74.0 days
Max Age :  74.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive, high-input resistance, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190509_sample_2.pvec
Note :  Abundant in L2/3, strong CCK expression, local dendritic and axonal morphologies "small CCK Basket cell". High input resistance.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  118.02 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  81
Number of Branches :  168
Overall Width :  193.47 μm
Overall Height :  600.19 μm
Overall Depth :  121.74 μm
Average Diameter :  0.51 μm
Total Length :  8411.97 μm
Total Surface :  14914.4 μm2
Total Volume :  3677.99 μm3
Max Euclidean Distance :  342.47 μm
Max Path Distance :  643.77 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  2755
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.05
Average Bifurcation Angle Local :  81.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.26°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website