8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161410
Cell Name :  20190503_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  112.0 days
Max Age :  112.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190503_sample_1.pvec
Note :  Upper L2/3. This reconstruction belongs to VIP Chat_2 subclass

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  245.04 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  47
Number of Branches :  98
Overall Width :  161.96 μm
Overall Height :  180.87 μm
Overall Depth :  75.49 μm
Average Diameter :  0.44 μm
Total Length :  4799.14 μm
Total Surface :  6399.51 μm2
Total Volume :  1768.15 μm3
Max Euclidean Distance :  146.85 μm
Max Path Distance :  609.01 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.69
Total Fragmentation :  2831
Partition Asymmetry :  0.65
Average Rall's Ratio :  1.64
Average Bifurcation Angle Local :  89.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  87.92°
Fractal Dimension :  1.09

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