8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161764
Cell Name :  20190416_sample_5
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  105.0 days
Max Age :  105.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 6
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Parvalbumin (PV)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190416_sample_5.pvec
Note :  L6, mostly local arborization within L6.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  1059.58 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  34
Overall Width :  262.49 μm
Overall Height :  368.72 μm
Overall Depth :  141.4 μm
Average Diameter :  0.49 μm
Total Length :  3044.44 μm
Total Surface :  4838.17 μm2
Total Volume :  777.25 μm3
Max Euclidean Distance :  269.39 μm
Max Path Distance :  409 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  1636
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  1.43
Average Bifurcation Angle Local :  80.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.95°
Fractal Dimension :  1.05

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