8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161312
Cell Name :  20190326_sample_2
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  101.0 days
Max Age :  101.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  high-input resistance, Cholecystokinin (CCK)-positive, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190326_sample_2.pvec
Note :  Abundant in L2/3, strong CCK expression, local dendritic and axonal morphologies "small CCK Basket cell". High input resistance.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  492.49 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  10
Number of Branches :  24
Overall Width :  176.07 μm
Overall Height :  231.33 μm
Overall Depth :  110.1 μm
Average Diameter :  0.52 μm
Total Length :  1693.03 μm
Total Surface :  2761.94 μm2
Total Volume :  460.82 μm3
Max Euclidean Distance :  165.82 μm
Max Path Distance :  206.27 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  486
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  1.26
Average Bifurcation Angle Local :  55.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  50.25°
Fractal Dimension :  1.04

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