8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161598
Cell Name :  20190322_sample_2
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Viaat-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  82.0 days
Max Age :  82.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Intratelencephalic (IT), Vesicular inhibitory amino acid (VIAAT)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190322_sample_2.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  391.75 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  59
Number of Branches :  130
Overall Width :  260.29 μm
Overall Height :  305.14 μm
Overall Depth :  93.43 μm
Average Diameter :  0.58 μm
Total Length :  6223.53 μm
Total Surface :  11346.6 μm2
Total Volume :  2140.36 μm3
Max Euclidean Distance :  259.28 μm
Max Path Distance :  393.14 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  2502
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  84.37°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.86°
Fractal Dimension :  1.04

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