8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161710
Cell Name :  20190226_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Viaat-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  134.0 days
Max Age :  134.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Inhibitory, Fast-spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Vesicular inhibitory amino acid transporter (VIAAT)-positive
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190226_sample_1.pvec
Note :  Upper L5, fast-spiking. Preferentially small (or shrub) basket cells.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  737.7 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  218
Number of Branches :  448
Overall Width :  294.55 μm
Overall Height :  296.17 μm
Overall Depth :  187.26 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  19189.3 μm
Total Surface :  16038.9 μm2
Total Volume :  4081.48 μm3
Max Euclidean Distance :  273.74 μm
Max Path Distance :  837.1 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  5563
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  91.54°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.32°
Fractal Dimension :  1.07

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