8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161303
Cell Name :  20190219_sample_8
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  VIP-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  100.0 days
Max Age :  100.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Excitatory
Tertiary Cell Class :  Intratelencephalic (IT), Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190219_sample_8.pvec
Note :  Often stellate or inverted morphology.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  522.37 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  48
Overall Width :  205.85 μm
Overall Height :  508.15 μm
Overall Depth :  84.95 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  3633.28 μm
Total Surface :  11499.5 μm2
Total Volume :  4079.3 μm3
Max Euclidean Distance :  508.57 μm
Max Path Distance :  769.77 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  1005
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  94.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.22°
Fractal Dimension :  1.07

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