8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161554
Cell Name :  20190212_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  113.0 days
Max Age :  113.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190212_sample_1.pvec
Note :  Abundant in L2/3, Martinotti morphology, adapting firing pattern. "Fanning-out" Martinotti morphology in upper L5. Non-zero ADP.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  2691.05 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  521
Number of Branches :  1055
Overall Width :  546.38 μm
Overall Height :  394.4 μm
Overall Depth :  131.88 μm
Average Diameter :  0.17 μm
Total Length :  31630.3 μm
Total Surface :  18705.9 μm2
Total Volume :  3127.97 μm3
Max Euclidean Distance :  480.64 μm
Max Path Distance :  842.27 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  15447
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  91.12°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.48°
Fractal Dimension :  1.06

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