8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161494
Cell Name :  20190122_sample_14
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  65.0 days
Max Age :  65.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Inhibitory, Fast-spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190122_sample_14.pvec
Note :  Upper L5, fast-spiking. Preferentially small (or shrub) basket cells.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  268.24 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  257
Number of Branches :  518
Overall Width :  274.48 μm
Overall Height :  456.37 μm
Overall Depth :  337.97 μm
Average Diameter :  0.09 μm
Total Length :  22180.9 μm
Total Surface :  6932.83 μm2
Total Volume :  814.56 μm3
Max Euclidean Distance :  449.94 μm
Max Path Distance :  949.6 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  10332
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  85.93°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.91°
Fractal Dimension :  1.05

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