8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161656
Cell Name :  20190110_sample_7
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  94.0 days
Max Age :  94.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Somatostatin (SOM)-negative, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20190110_sample_7.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  844.67 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  99
Overall Width :  238.03 μm
Overall Height :  431.51 μm
Overall Depth :  60.78 μm
Average Diameter :  0.72 μm
Total Length :  4922.55 μm
Total Surface :  10869.8 μm2
Total Volume :  2488.09 μm3
Max Euclidean Distance :  366.84 μm
Max Path Distance :  431.82 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  599
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  76.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.65°
Fractal Dimension :  1.02

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