8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161257
Cell Name :  20180921_sample_3
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  94.0 days
Max Age :  94.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Inhibitory, Fast-spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived, Somatostatin (SOM)-positive
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180921_sample_3.pvec
Note :  Middle L5, fast-spiking. Preferentially horizontal elongated basket cells.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  963.55 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  196
Number of Branches :  393
Overall Width :  385.11 μm
Overall Height :  512.88 μm
Overall Depth :  125.27 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  16139.9 μm
Total Surface :  3841.9 μm2
Total Volume :  84.61 μm3
Max Euclidean Distance :  502.48 μm
Max Path Distance :  689.17 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  6638
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.91
Average Bifurcation Angle Local :  89.8°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.79°
Fractal Dimension :  1.05

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