8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161217
Cell Name :  20180820_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  62.0 days
Max Age :  62.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Somatostatin (SOM)-positive
Tertiary Cell Class :  Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180820_sample_1.pvec
Note :  Lower L2/3 and upper L5, Martinotti morphology. Compared to Calb2, denser local axons, sparser "Fanning-out" projections to L1, smaller time constant. Non-zero ADP.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  406.69 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  155
Number of Branches :  312
Overall Width :  503.1 μm
Overall Height :  403.69 μm
Overall Depth :  197.41 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  15614.1 μm
Total Surface :  3872.3 μm2
Total Volume :  121.48 μm3
Max Euclidean Distance :  416.44 μm
Max Path Distance :  834.34 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  4440
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.08
Average Bifurcation Angle Local :  83.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.37°
Fractal Dimension :  1.06

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