8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141665
Cell Name :  20180820_Sim_03
Archive Name :  Takahashi
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/J (Sim1-Cre x Ai9)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  pyramidal tract (PT) cell [Sim1+]
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-10-11
Date of Upload :  2020-10-20
Persistence Vector :  20180820_Sim_03.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Active dendritic currents gate descending cortical outputs in perception.

Measurements
Soma Surface :  673.79 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  80
Overall Width :  223.86 μm
Overall Height :  590.77 μm
Overall Depth :  63.52 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  4154.9 μm
Total Surface :  8176.87 μm2
Total Volume :  1685.52 μm3
Max Euclidean Distance :  498.84 μm
Max Path Distance :  583.43 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1424
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.34
Average Bifurcation Angle Local :  71.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.27°
Fractal Dimension :  1.04

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