8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161727
Cell Name :  20180709_sample_2
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Viaat-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  72.0 days
Max Age :  72.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Intratelencephalic (IT), Vesicular inhibitory amino acid (VIAAT)-negative
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180709_sample_2.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  634.39 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  59
Overall Width :  217.56 μm
Overall Height :  319.48 μm
Overall Depth :  67.96 μm
Average Diameter :  1.54 μm
Total Length :  3176.57 μm
Total Surface :  15571.1 μm2
Total Volume :  6592.34 μm3
Max Euclidean Distance :  294.22 μm
Max Path Distance :  386.01 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  2419
Partition Asymmetry :  0.34
Average Rall's Ratio :  1.84
Average Bifurcation Angle Local :  93.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.15°
Fractal Dimension :  1.05

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