8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161761
Cell Name :  20180621_sample_4
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  125.0 days
Max Age :  125.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180621_sample_4.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  759.19 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  66
Overall Width :  161.04 μm
Overall Height :  262.48 μm
Overall Depth :  100.14 μm
Average Diameter :  0.55 μm
Total Length :  4166.36 μm
Total Surface :  7368.51 μm2
Total Volume :  1484.28 μm3
Max Euclidean Distance :  211.93 μm
Max Path Distance :  344.9 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.69
Total Fragmentation :  4309
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  1.43
Average Bifurcation Angle Local :  65.38°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.36°
Fractal Dimension :  1.09

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