8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161440
Cell Name :  20180522_sample_7
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  106.0 days
Max Age :  106.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180522_sample_7.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  693.57 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  48
Overall Width :  191.53 μm
Overall Height :  307.88 μm
Overall Depth :  77.48 μm
Average Diameter :  0.83 μm
Total Length :  2881.23 μm
Total Surface :  7444.51 μm2
Total Volume :  1786.31 μm3
Max Euclidean Distance :  250.07 μm
Max Path Distance :  332.63 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  2843
Partition Asymmetry :  0.29
Average Rall's Ratio :  1.69
Average Bifurcation Angle Local :  89.91°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.37°
Fractal Dimension :  1.05

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