8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161677
Cell Name :  20180509_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  83.0 days
Max Age :  83.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Excitatory
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180509_sample_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  604.69 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  93
Overall Width :  259.11 μm
Overall Height :  392.62 μm
Overall Depth :  113.39 μm
Average Diameter :  0.38 μm
Total Length :  6352.12 μm
Total Surface :  7622.77 μm2
Total Volume :  1426.2 μm3
Max Euclidean Distance :  279.12 μm
Max Path Distance :  409.07 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  3013
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.41
Average Bifurcation Angle Local :  81.86°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.33°
Fractal Dimension :  1.08

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