8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161833
Cell Name :  20180501_sample_5
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  98.0 days
Max Age :  98.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180501_sample_5.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  662.34 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  45
Overall Width :  221.78 μm
Overall Height :  379.98 μm
Overall Depth :  138.93 μm
Average Diameter :  1.35 μm
Total Length :  2867.75 μm
Total Surface :  11798.3 μm2
Total Volume :  4141.73 μm3
Max Euclidean Distance :  316.6 μm
Max Path Distance :  416.98 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  1894
Partition Asymmetry :  0.31
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  100.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.04°
Fractal Dimension :  1.07

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