8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161315
Cell Name :  20180425_sample_8
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  89.0 days
Max Age :  89.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Vasoactive Intestinal Peptide (VIP)-positive
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive, high-input resistance, Caudal Ganglionic Eminence (CGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180425_sample_8.pvec
Note :  Abundant in L2/3, strong CCK expression, local dendritic and axonal morphologies "small CCK Basket cell". High input resistance.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  650.68 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  42
Overall Width :  275 μm
Overall Height :  275.36 μm
Overall Depth :  103.65 μm
Average Diameter :  0.28 μm
Total Length :  3245.67 μm
Total Surface :  2910.43 μm2
Total Volume :  315.19 μm3
Max Euclidean Distance :  205.2 μm
Max Path Distance :  305.72 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  4046
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.31
Average Bifurcation Angle Local :  88.41°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.3°
Fractal Dimension :  1.08

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