8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141669
Cell Name :  20180425_Sim_01
Archive Name :  Takahashi
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6/J (Sim1-Cre x Ai9)
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  40.0 days
Max Age :  40.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  pyramidal tract (PT) cell [Sim1+]
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-10-11
Date of Upload :  2020-10-20
Persistence Vector :  20180425_Sim_01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Active dendritic currents gate descending cortical outputs in perception.

Measurements
Soma Surface :  805.77 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  100
Overall Width :  245.99 μm
Overall Height :  718 μm
Overall Depth :  109.28 μm
Average Diameter :  0.73 μm
Total Length :  5477.97 μm
Total Surface :  12854.6 μm2
Total Volume :  2976.81 μm3
Max Euclidean Distance :  617.61 μm
Max Path Distance :  726.69 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  2128
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.39
Average Bifurcation Angle Local :  74.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.95°
Fractal Dimension :  1.04

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