8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161239
Cell Name :  20180225_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  57.0 days
Max Age :  57.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Parvalbumin (PV)-negative, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180225_sample_1.pvec
Note :  Abundant in L2/3. Tufted pyramidal cells with high rheobase.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  499.25 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  53
Number of Branches :  115
Overall Width :  210.36 μm
Overall Height :  292.12 μm
Overall Depth :  103.28 μm
Average Diameter :  0.43 μm
Total Length :  6114.36 μm
Total Surface :  7886.63 μm2
Total Volume :  1300.82 μm3
Max Euclidean Distance :  286.4 μm
Max Path Distance :  460.95 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.73
Total Fragmentation :  2605
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.51
Average Bifurcation Angle Local :  85.1°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.56°
Fractal Dimension :  1.08

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