8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161426
Cell Name :  20180215_sample_1
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  77.0 days
Max Age :  77.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive
Tertiary Cell Class :  Inhibitory, Fast-spiking, Medial Ganglionic Eminence (MGE)-derived
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180215_sample_1.pvec
Note :  Upper L5, fast-spiking. Preferentially small (or shrub) basket cells.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  1444.92 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  207
Number of Branches :  426
Overall Width :  377.04 μm
Overall Height :  553.62 μm
Overall Depth :  161.01 μm
Average Diameter :  0.34 μm
Total Length :  28895.6 μm
Total Surface :  30492.5 μm2
Total Volume :  6686.98 μm3
Max Euclidean Distance :  444.49 μm
Max Path Distance :  1304.99 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.74
Total Fragmentation :  6914
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  88.38°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.81°
Fractal Dimension :  1.07

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