8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_125905
Cell Name :  20180209_S1W1C1
Archive Name :  Fried
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Thy1-EGFP)MJrs
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Alpha, ON-sustained
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Multiple
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-11-21
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  20180209_S1W1C1.pvec
Note :  Dendrites were reconstructed at 20x, axons at 63x

Reference Article
Related Article Reference :  Scaling of the AIS and Somatodendritic Compartments in alpha S RGCs.

Measurements
Soma Surface :  1397.62 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  75
Overall Width :  1179.13 μm
Overall Height :  313.87 μm
Overall Depth :  10.93 μm
Average Diameter :  0.9 μm
Total Length :  5490.94 μm
Total Surface :  16975.4 μm2
Total Volume :  4689.97 μm3
Max Euclidean Distance :  1088.53 μm
Max Path Distance :  1101.18 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  4586
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  0.96
Average Bifurcation Angle Local :  87.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.26°
Fractal Dimension :  1.05

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