8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161749
Cell Name :  20180115_sample_8
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  64.0 days
Max Age :  64.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Parvalbumin (PV)-negative, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20180115_sample_8.pvec
Note :  L5. Large tufted pyramidal neurons. L5-projecting.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  723.54 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  89
Overall Width :  240.72 μm
Overall Height :  712.55 μm
Overall Depth :  100.69 μm
Average Diameter :  0.22 μm
Total Length :  6611.39 μm
Total Surface :  4707.61 μm2
Total Volume :  634.04 μm3
Max Euclidean Distance :  560.76 μm
Max Path Distance :  677.6 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  3200
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.13
Average Bifurcation Angle Local :  87.02°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.58°
Fractal Dimension :  1.06

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