8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161880
Cell Name :  20171219_sample_3
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  Pvalb-Cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  61.0 days
Max Age :  61.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Parvalbumin (PV)-negative, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20171219_sample_3.pvec
Note :  L5. Large tufted pyramidal neurons.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  651.13 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  36
Number of Branches :  83
Overall Width :  357.94 μm
Overall Height :  308.84 μm
Overall Depth :  67.58 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  5050.78 μm
Total Surface :  3930.9 μm2
Total Volume :  391.63 μm3
Max Euclidean Distance :  410.98 μm
Max Path Distance :  544.43 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  2979
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.44
Average Bifurcation Angle Local :  62.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.39°
Fractal Dimension :  1.05

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