8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_161851
Cell Name :  20171207_sample_6
Archive Name :  Tolias
Species Name :  mouse
Strain :  SST-cre;Ai9
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  80.0 days
Max Age :  80.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  primary motor, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, Somatostatin (SOM)-negative, Intratelencephalic (IT)
Original Format :  Neurolucida.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-01-24
Date of Upload :  2021-08-05
Persistence Vector :  20171207_sample_6.pvec
Note :  L5. Large tufted pyramidal neurons.

Reference Article
Related Article Reference :  Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex.

Measurements
Soma Surface :  743.14 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  85
Overall Width :  308.65 μm
Overall Height :  831.96 μm
Overall Depth :  79.22 μm
Average Diameter :  0.41 μm
Total Length :  5516.32 μm
Total Surface :  6843.68 μm2
Total Volume :  1389.52 μm3
Max Euclidean Distance :  777.79 μm
Max Path Distance :  919.7 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  2982
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.35
Average Bifurcation Angle Local :  79.18°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.21°
Fractal Dimension :  1.05

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