8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_125910
Cell Name :  20171004_S1W3C2
Archive Name :  Fried
Species Name :  mouse
Strain :  Tg(Thy1-EGFP)MJrs
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  35.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Alpha, ON-sustained
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Streptavidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Multiple
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-11-21
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  20171004_S1W3C2.pvec
Note :  Dendrites were reconstructed at 20x, axons at 63x

Reference Article
Related Article Reference :  Scaling of the AIS and Somatodendritic Compartments in alpha S RGCs.

Measurements
Soma Surface :  1117.63 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  35
Number of Branches :  75
Overall Width :  809.33 μm
Overall Height :  546.41 μm
Overall Depth :  16.25 μm
Average Diameter :  0.92 μm
Total Length :  5995.68 μm
Total Surface :  18202.6 μm2
Total Volume :  4757.57 μm3
Max Euclidean Distance :  1006.95 μm
Max Path Distance :  1015.97 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  6483
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  0.98
Average Bifurcation Angle Local :  85.59°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.45°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website