8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132366
Cell Name :  20170923_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  pretectal region, left
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  periventricular
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  20170923_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d7_F3.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1507.88 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  62
Number of Branches :  125
Overall Width :  56.51 μm
Overall Height :  138.55 μm
Overall Depth :  161.77 μm
Average Diameter :  3.67 μm
Total Length :  1430.04 μm
Total Surface :  16918.9 μm2
Total Volume :  16575 μm3
Max Euclidean Distance :  155.25 μm
Max Path Distance :  361.97 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  765
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2.11
Average Bifurcation Angle Local :  77.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.72°
Fractal Dimension :  1.04

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