8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_282635
Cell Name :  20170809_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  5.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  medial
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Periventricular Projection Neurons (PVPN)
Tertiary Cell Class :  Class 6b, Hypothalamus-projecting, Medulla oblongata-projecting, Thalamus-projecting, Lateral tegmentum-projecting
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  whole mount
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-11-24
Date of Upload :  2024-04-30
Persistence Vector :  20170809_BGUG_HuC_ltRFP_d5_F3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Topography of a Visuomotor Transformation.

Measurements
Soma Surface :  1354.27 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  93
Overall Width :  74.97 μm
Overall Height :  132.81 μm
Overall Depth :  289.99 μm
Average Diameter :  3.73 μm
Total Length :  1406.25 μm
Total Surface :  17019.5 μm2
Total Volume :  17264.9 μm3
Max Euclidean Distance :  279.21 μm
Max Path Distance :  627.99 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  812
Partition Asymmetry :  0.63
Average Rall's Ratio :  2.25
Average Bifurcation Angle Local :  86.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.75°
Fractal Dimension :  1.04

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