8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132363
Cell Name :  20170406_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F8
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1013tET
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  pretectal region, right
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  periventricular
Tertiary Cell Class :  projection
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  20170406_1013_BGUG_HuC_ltRFP_d6_F8.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  354.06 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  45
Overall Width :  63.31 μm
Overall Height :  125.53 μm
Overall Depth :  42.03 μm
Average Diameter :  4.01 μm
Total Length :  968.37 μm
Total Surface :  12521.2 μm2
Total Volume :  13305.3 μm3
Max Euclidean Distance :  149.19 μm
Max Path Distance :  216.12 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  258
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  1.94
Average Bifurcation Angle Local :  70.9°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.36°
Fractal Dimension :  1.02

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