8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93409
Cell Name :  20170213-3-004
Archive Name :  Lee_LJ
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL6 x B6.129P2(C)-Mecp2-/y
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.2 months
Max Age :  1.2 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory, barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  flattened
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  15x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2018-03-31
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  20170213-3-004.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Structural and functional differences in the barrel cortex of Mecp2 null mice.

Measurements
Soma Surface :  394.55 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  80
Overall Width :  121.93 μm
Overall Height :  205.72 μm
Overall Depth :  18.42 μm
Average Diameter :  0.18 μm
Total Length :  1701.96 μm
Total Surface :  962.44 μm2
Total Volume :  43.31 μm3
Max Euclidean Distance :  180.18 μm
Max Path Distance :  220.15 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  493
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  79.32°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.55°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website